Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700018F24RikB2RW27 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms