Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms