Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Abcc8B2RUS7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Abcc8B2RUS7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Abcc8B2RUS7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms