Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Apba1B2RUJ5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms