Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc22a28B2RT89 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms