Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apol7aB2RT54 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms