Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf518aB2RRF6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Znf518aB2RRF6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf518aB2RRF6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf518aB2RRF6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf518aB2RRF6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms