Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035947B2RQY6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035947B2RQY6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms