Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H60cB1B213 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H60cB1B213 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H60cB1B213 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H60cB1B213 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms