Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr2B1AVP0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr2B1AVP0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms