Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpruB1AUH1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpruB1AUH1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
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