Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
1700042G07RikB1AUF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
1700042G07RikB1AUF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms