Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik3B1AS29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms