Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skint2A7XUX6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms