Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfkfb3A7UAK5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms