Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms