Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss40A6H6T1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prss40A6H6T1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prss40A6H6T1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms