Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms