Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn3aA2ASI5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms