Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtf1A2AQ19 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtf1A2AQ19 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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