Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SetxA2AKX3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms