Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Frmpd1A2AKB4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Frmpd1A2AKB4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Frmpd1A2AKB4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms