Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VirmaA2AIV2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VirmaA2AIV2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms