Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin3aA2AIR5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin3aA2AIR5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms