Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms