Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms