Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930447F04RikA2AFR2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms