Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d1A2AE42 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms