Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700023F06RikA2AB62 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700023F06RikA2AB62 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms