Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm2A2A7B5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm2A2A7B5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms