Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgap3A2A559 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pgap3A2A559 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms