Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc112A0AUP1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms