Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RNP2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms