Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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