Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trbv31A0A075B5J5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv31A0A075B5J5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv31A0A075B5J5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trbv31A0A075B5J5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv31A0A075B5J5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv31A0A075B5J5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv31A0A075B5J5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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