Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms