Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm4T1NXB5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm4T1NXB5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms