Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt27Q9Z320 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt27Q9Z320 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms