Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn6Q9Z262 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn6Q9Z262 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn6Q9Z262 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms