Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn8Q9Z260 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms