Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms