Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
D17h6s53eQ9Z1R4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms