Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VarsQ9Z1Q9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VarsQ9Z1Q9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms