Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms