Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1pr4Q9Z0L1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms