Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms