Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp1a4Q9WV27 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms