Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms