Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stub1Q9WUD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms