Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd6ipQ9WU78 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd6ipQ9WU78 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms